2007年4月，日本国会制定并通过《海洋基本法》。同年《海洋构筑物安全水域设定法》开始实施。2008年3月，以福田康夫为本部长的综合海洋政策本部和内阁会议，审议并通过根据《海洋基本法》制定的《海洋基本计划》，提出“为管理海洋而保全离岛”。2009年12月，鸠山内阁发布《海洋保全和管理离岛的基本方针》，把落实《海洋基本法》的规定作为内阁的首要工作，首次提出“要确保超过国土面积12倍，约447万平方公里的专属经济区的管辖海域”的海洋战略，为此“要全力保全日本专属经济区及大陆架外缘的离岛”，促使“国家取得为专属经济区提供外缘依据的离岛基线，同时研究作为国有资产管理的政策”。2010年，日本政府提出《日本海洋状况及关于海洋施政方针》，明确规定领海以及专属经济区等管理海域约为447万平方公里。同年2月，日本国会通过《促进保全和利用专属经济区、大陆架、低潮线以及建设据点设施的法律》。依据该法规定，日本内阁官房于6月24日发布施行令，将法律规定转化为具有可操作性的行政法令。7月13日，综合海洋政策本部公布基本计划，明确了推进海洋战略的具体措施和实施路径，确定了将低潮线周边无主土地行政财产化的方针，并确定了指礁为岛的“特定离岛”政策。2011年10月，日本政府命名包括冲之鸟礁在内的39座离岛，继续以政府行为扩大和控制专属经济区。2012年2月，野田内阁批准了《海上保安厅法》和《外国船舶航行法》修正案，日本国会于8月予以审议并通过。规定“海上保安厅的设施、船舶和航空器”得以代替“警察局、派出所或驻在所”等执法机构对“离岛海域的犯罪”执法，保安官有权作为刑事诉讼法规定的司法警察履行执法权。2013年4月，安倍内阁公布了《海洋基本计划》修订草案，明确提出“确保海洋安全”的方针，主张在继续推进海洋战略的同时，着重加强应对中国压力，争取海洋权益的实力建设。在日本政府的海洋战略框架中，法律体系是最重要的构成部分。在《海洋基本法》的框架之下，日本政府不断修改现有部门法（《海岸法》、《港湾法》、《水产资源保护法》、《海洋资源开发促进法》、《自卫队法》、《海上保安厅法》），制定新行政法令、部门法规等相关配套法规。日本政府的海洋战略随着实施海洋战略的法律和政策的不断出台进一步法制化、明确化。依据《海洋基本法》的授权，日本政府设置了以内阁总理大臣为本部长、内阁官房长官和海洋政策担当大臣为副本部长、各相关省厅大臣参加的综合海洋政策本部。作为超越部门利益、体现一元化中央集权管理权威、负责国家海洋战略的决策、指挥和协调的机构，其地位相当于战后的通商产业省和大藏省经济企划厅。按照《海洋基本法》规定，综合海洋政策本部负责起草、制定和修改《海洋基本计划》（每5年应制定新的《海洋基本计划》）；编制海洋事业预算（自2009年以来，每年预算金额都超过1兆日元以上，占同期日本国民生产总值的五百分之一以上）；协调各行政部门在职权范围内依据《海洋基本法》制定行政法令、实施政策措施；有权通过防卫省、国土交通省分别指挥海上自卫队、海上保安厅。内阁官房作为综合海洋政策本部的事务局，负责管理日常行政事务，联系中央各省厅、地方自治体、独立行政法人、学术研究机构、资源管理和技术开发团队，发挥枢纽型的关键作用。在日本海洋事业管理的行政体制中，以下三个中央省厅最为重要和关键。外务省：作为主管日本政府对外关系的专职机构，从外交政策的实施方面积极配合推进海洋战略的实施。外务省参与海洋事务的部门中担任重要工作的包括国际合作局地球环境课、综合政策局安全保障课及海上安全保障室、国际条法局国际法课海洋室、经济局渔业课、欧洲局俄罗斯课、亚洲太平洋局中国蒙古课和东北亚课。防卫省：为强化对小型水面舰艇的快速反应能力、对周边海域的警戒监视能力、对潜艇的侦察、识别和跟踪能力、应对海上冲突的能力、确保海上航行安全的能力，通过增加海洋防卫预算，更新特别警备部队的装备，采购扫雷机、扫雷舰、新型护卫舰，防卫省强化了海上自卫队对海洋的监视、警戒、应对和反击能力。同时，防卫省下属防卫技术研究本部着力研究“有助于确保海洋安全的装备”，其中应对潜艇消音化、隐性化的声呐技术和提高潜艇的鱼雷攻击能力的两项课题研发费用合计为100多亿日元。国土交通省：该部门管辖的事务囊括了包括陆地和海洋在内的日本全部领土。与海洋事业相关的业务包括划定专属经济区和大陆架基点基线、测量航路和海底水文地质、制作海图、设置并维护航标、帮助地方自治体开发振兴离岛、建设和健全海湾和海港的设施、处理海洋污染、实施海上救援、维护海上治安等，所有非军事的海洋事务都在该部门的管辖之下，该部门所承担的国家级海洋项目也最多。上述三个中央省厅分别从国家外交的拓展、防卫力量的支持、海洋事务的日常管理三个方面，构成了日本政府推行海洋战略的行政管辖和政策实施的核心部门。在日本政府推进海洋战略的进程中，日本海洋研究界大力参与、超前设计，为海洋战略的制订和决策提供学术性的资源。日本海洋研究财团负责筹集资金，为各种研究海洋问题的研究机构提供经费支持，包括日本海洋研究开发机构、海洋能源资源利用推进机构、日本海洋政策研究会、海洋基本法战略研究会、海洋产业研究会、水产学会、海洋政策学会、东京大学海洋研究所、东海大学海洋研究所。其中日本海洋政策研究会经过多年策划，于2006年12月完成了《海洋政策大纲》和《海洋基本法案概要》并提交给总理大臣麻生太郎，成为日本政府制定海洋战略的蓝本。随着日本海洋战略框架基本完成，其战略意图也一览无余：与美国结盟共同主导亚太海洋秩序，确保地区稳定和日本周边海域、海上通道的安全；积极扩张战略空间、占据毗邻海域和公共海域、实现“海洋国土化”以确保对海洋资源的控制。